En ung kvinde findes hængt ved Skovmøllen kro i Moesgaard. Hun har ingen personlige effekter på sig, og efterforskere Teddy Falk og Simone Schmidt er på bar bund med at identificere hende.

Samtidig er Chris Rantzau Cortes kommet ud af Enner Mark fængsel efter at have afsonet en dom på to og et halvt år for drabet på Spøgelset. Men han er usikker på, hvad hans næste skridt skal være.

Da han bliver ringet op af den dødssyge Lise Löve, der beder ham om hjælp til at lokalisere hendes forsvundne søn Jonas, vælger han først at sige nej til opgaven, da han er færdig med at lede efter forsvundne personer. Et besøg fra hans søster Regitze får ham dog på andre tanker, og inden længe viser det sig, at der ligger mere bag Jonas Löves forsvinding, end Chris kunne have forestillet sig.

Snart må Chris slå sig sammen med Teddy Falk og Simone Schmidt for at finde ud af, hvad der er sket med Jonas, og hvem den mystiske afdøde i Moesgaard er, og hvordan de to sager hænger sammen.

Blod Farver Havet Blåt er tredje og sidste del i trilogien om dusørjægeren Chris Rantzau Cortes.